Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sec61bQ9CQS8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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