Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTRAFQ9CQE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTRAFQ9CQE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms