Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ergic3Q9CQE7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ergic3Q9CQE7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms