Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms