Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole4Q9CQ36 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole4Q9CQ36 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms