Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
StambpQ9CQ26 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
StambpQ9CQ26 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms