Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska1Q9CPV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska1Q9CPV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms