Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt23Q99PS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms