Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms