Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rad54l2Q99NG0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rad54l2Q99NG0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad54l2Q99NG0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad54l2Q99NG0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad54l2Q99NG0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad54l2Q99NG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms