Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep41Q99NF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep41Q99NF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms