Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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