Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp26Q99MX1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp26Q99MX1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms