Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KarsQ99MN1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KarsQ99MN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms