Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkd1Q99MH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkd1Q99MH6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms