Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b4Q99ME6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms