Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gdpd3Q99LY2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdpd3Q99LY2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms