Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nus1Q99LJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms