Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmtm3Q99LJ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms