Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nmd3Q99L48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms