Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds2Q99L43 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds2Q99L43 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms