Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99KU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99KU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99KU6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99KU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99KU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99KU6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99KU6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99KU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99KU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99KU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99KU6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99KU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99KU6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q99KU6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Q99KU6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q99KU6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms