Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dctn2Q99KJ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms