Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lims1Q99JW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms