Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn3Q99JH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn3Q99JH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn3Q99JH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms