Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Def8Q99J78 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Def8Q99J78 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms