Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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