Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdgfdQ925I7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfdQ925I7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms