Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss28Q924N9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss28Q924N9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms