Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alpk3Q924C5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alpk3Q924C5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alpk3Q924C5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms