Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim7Q923T7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim7Q923T7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms