Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim59Q922Y2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim59Q922Y2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim59Q922Y2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms