Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Clip1Q922J3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clip1Q922J3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms