Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms