Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a4Q91VA1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc44a4Q91VA1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a4Q91VA1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a4Q91VA1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a4Q91VA1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a4Q91VA1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a4Q91VA1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms