Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms