Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc3Q8VEM9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhdc3Q8VEM9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms