Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rdh10Q8VCH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh10Q8VCH7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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