Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdsQ8VBT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdsQ8VBT2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdsQ8VBT2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdsQ8VBT2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SdsQ8VBT2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdsQ8VBT2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SdsQ8VBT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms