Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Agr3Q8R3W7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Agr3Q8R3W7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Agr3Q8R3W7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Agr3Q8R3W7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Agr3Q8R3W7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Agr3Q8R3W7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms