Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc58Q8R3Q6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms