Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms