Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms