Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc12Q8K5B8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms