Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Depp1Q8K2F3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms