Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtmr3Q8K296 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mtmr3Q8K296 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms