Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Neil3Q8K203 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms