Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn34c1Q8K193 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c1Q8K193 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn34c1Q8K193 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn34c1Q8K193 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c1Q8K193 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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