Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkn3Q8K045 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkn3Q8K045 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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