Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SbsnQ8CIT9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SbsnQ8CIT9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms